2014年7月18日 ソフトウェアインストールのお知らせ

国立遺伝学研究所スーパーコンピュータシステム利用者各位

2014年7月18日
国立遺伝学研究所 DDBJセンター スーパーコンピュータシステム管理チーム

平素より、国立遺伝学研究所(以下 遺伝研) スーパーコンピュータシステム(以下 スパコン)を ご利用いただき誠に有難うございます。

7月18日に以下、ソフトウェアのインストールを行いました。

なお、各ソフトウェアのcurrentへのリンクは変更ありません。詳細はこちらを参照下さい。

1.詳細

    • ソフト名称:ALLPATHS-LG

   version:50095

   インストール先 /usr/local/pkg/ALLPATHS-LG/50095/

    • ソフト名称:BEDTools

   version:2.17.0

   インストール先 /usr/local/pkg/BEDTools/2.17.0/

    • ソフト名称:BLAT

   version:35

   インストール先 /usr/local/pkg/BLAT/35/

    • ソフト名称:GATK

   version:1.6-9-g47df7bb

   インストール先 /usr/local/pkg/GATK/1.6-9-g47df7bb/

    • ソフト名称:SOAPdenovo

   version:2.04-r240

   インストール先 /usr/local/pkg/SOAPdenovo/2.04-r240/

    • ソフト名称:Trinity

   version:r20140413p1

   インストール先 /usr/local/pkg/Trinity/r20140413p1/

    • ソフト名称:bowtie

   version:1.0.1

   インストール先 /usr/local/pkg/bowtie/bowtie-1.0.1/

    • ソフト名称:bowtie2

   version:2.2.3

   インストール先 /usr/local/pkg/bowtie2/2.2.3/

    • ソフト名称:bwa

   version:0.7.9a

   インストール先 /usr/local/pkg/bwa/0.7.9a/

    • ソフト名称:mafft

   version:7.158

   インストール先 /usr/local/pkg/mafft/7.158/

    • ソフト名称:ncbi_cxx_toolkit

   version:12.0.0

   インストール先 /usr/local/pkg/ncbi_cxx_toolkit/12.0.0/

    • ソフト名称:samtools

   version:0.1.19

   インストール先 /usr/local/pkg/samtools/0.1.19/

    • ソフト名称:velvet

   version:1.2.10

   インストール先 /usr/local/pkg/velvet/velvet_1.2.10/

以上、宜しくお願いします。