国立遺伝学研究所は生命・医学系研究における情報処理のための大規模計算基盤として、大規模クラスタ型計算機・大規模メモリ共有型計算機・大容量高速ディスク装置を備えた最新鋭のスーパーコンピュータシステムサービスを提供しています。
ディスク容量が逼迫しているためユーザーホームディレクトリ内のデータについて当研究所ではバックアップを取っておりません。免責事項の通り、利用者の責任においてバックアップを取っていただくようお願いいたします。
2019年3月5日 遺伝研スパコンをリプレースし新スパコンの公開を開始しました。
| 2012年3月導入 前スパコン(第4期) |
2019年3月導入 新スパコン(第5期) |
説明 | ||
| 計算ノード | Thin計算ノード |
554台 |
204台 |
Thin計算ノード204台中1/3がIntel Xeon Gold 6130, 2/3がAMD EPYC7501を搭載。 204台中64台をDDBJの業務で使用。 課金枠は最大で残りの半数(70台)想定。 (注意)Fat計算ノードはUGEで制御できない仕様となったため課金によるノード貸しによる利用のみとなりました。 |
| Medium計算ノード | 2TBメモリ 10台 | 3TBメモリ 10台 | ||
| Fat計算ノード | 10TBメモリ1台 | 12TBメモリ 1台 | ||
| ストレージ | 高速ストレージ | 合計7PB | 合計13.6PB | 一般計算用 |
| アーカイブストレージ | 5.6PB | 30PB | DDBJのデータベース、および課金による利用 | |
| ノード間相互結合網 | InfiniBand 4xQDR (32Gbps) |
InfiniBand 4xEDR (100Gbps) |
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DDBJ Pipeline の後継・代替解析サービスとして Maser をご案内しております。
ユーザーアカウントやデータ等は引き継がれませんので、ご利用を希望する方は下記ページよりユーザー登録をお願い致します。
http://cell-innovation.nig.ac.jp/public/contents/service.html
今年度のアカウント年度末申請は、スパコンリプレースに伴うシステム変更の都合で5/31まで受け付けます。
遺伝研スパコンで利用可能なAsperaサーバーの帯域幅上限を2018年3月末に10Gbpsに増強しました。特に海外とのデータ転送など遠距離間の高速な通信が可能になりました。
今年度の定期メンテナンスは、現時点では、7月上旬と12月頃（遺伝研法定停電の日程）の予定です。
7月上旬の定期メンテナンスの日程は以下の通りです。
2019年 7 月 1 日 (月) 9:00 ~ 7 月 4 日 (木) 24:00
詳細は該当のお知らせのページをご参照ください。
遺伝研スーパーコンピュータシステムの活動は皆様の謝辞で評価されています。当スーパーコンピュータシステムを利用した論文が採択された際には以下の記載例を参考に謝辞への記載をお願いします。
記載例
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＜謝辞 英語＞
Computations were partially performed on the NIG supercomputer
at ROIS National Institute of Genetics.
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＜謝辞 日本語＞
本研究は、情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所が
有する遺伝研スーパーコンピュータシステムを利用しました。
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