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データ転送(個人ゲノム解析区画)

SSH プロトコルによるファイル転送の方法 (scp, sftp)

個人ゲノム解析区画のゲートウェイサーバ(gwa.ddbj.nig.ac.jp)に対して scp, sftp 等を用いたファイル転送が可能です。

Linux または Mac の場合の例:

この状態で、カレントディレクトリにあるyour_file.txtファイルを遺伝研スパコンに scp するには、 以下のコマンドを実行します。

ここでyouは、遺伝研スパコンのアカウント名です。

scp your_file.txt you@gwa.ddbj.nig.ac.jp:/home/you

Windows (PowerShell) の場合の例:

  1. まず PowerShell を起動します。そうすると、デフォルトの場合では、Windows 内のホームディレクトリがカレントディレクトリになった状態で PowerShell が起動します(ここで"youwin" は Windows のアカウント名)。この状態で以下のコマンドを実行して、SSH 秘密鍵ファイルが以下の位置にあることを確認します。この場合の SSH 秘密鍵ファイルは、id_rsa ファイルのことです。
PS C:\Users\youwin> ls .ssh


Directory: C:\Users\youwin\.ssh


Mode LastWriteTime Length Name
---- ------------- ------ ----
-a---- 2023/11/28 16:18 160 config
-a---- 2022/11/01 16:33 1766 id_rsa
-a---- 2024/01/22 12:44 4885 known_hosts
-a---- 2024/01/22 12:41 5453 known_hosts.old
  1. この状態で、ダウンロードフォルダ(Downloads)の中にあるyour_file.txtファイルを遺伝研スパコンに scp するには、 以下のコマンドを実行します。(ここでyouは、遺伝研スパコンのアカウント名です。)
PS C:\Users\youwin> scp .\Downloads\your_file.txt
you@gwa.ddbj.nig.ac.jp:/home/you

Archaea tools(旧 HCPtools) によるファイル転送の方法

転送方法は、Archaea tools(旧 HCPtools) の使い方をご参照下さい。