Jupyter Labの使い方
Jupyter Labのインストール
Minicondaをインストールしているのであれば、以下のコマンドでJuypter Labをインストールできます。
conda install -c conda-forge jupyterlab
以下のコマンドにてconfigファイルを生成します。
jupyter server --generate-config
以下のコマンドにてパスワードを設定します。
jupyter server --generate-config
Jupyter Labサーバーの起動
まず最初に、qloginにより割り当てられたインタラクティブノードのローカルIPアドレスを調べます。
$ ip a | grep ib0
10: ib0: <BROADCAST,MULTICAST,UP,LOWER_UP> mtu 1500 qdisc mq state UP group default qlen 256
inet 172.19.7.186/20 brd 172.19.15.255 scope global ib0
この例の場合はqloginにより割り当てられたインタラクティブノードのローカルIPアドレスは172.19.7.186です。
次にインタラクティブノード上でJuypter Labサーバーを起動します。
$ jupyter lab --no-browser --ip "*"
起動すると最後に以下のようなメッセージが出ます。（プロンプトは返ってきません。このままつないでおきます。Ctrl-Cで終了します。）
$ jupyter lab --no-browser --ip "*"
[I 2021-08-13 09:55:43.340 ServerApp] jupyterlab | extension was successfully linked.
[I 2021-08-13 09:55:43.707 ServerApp] nbclassic | extension was successfully linked.
[W 2021-08-13 09:55:44.145 ServerApp] WARNING: The Jupyter server is listening on all IP addresses and not using encryption. This is not recommended.
[I 2021-08-13 09:55:44.245 ServerApp] nbclassic | extension was successfully loaded.
...
[I 2021-08-13 09:55:44.250 ServerApp] Jupyter Server 1.10.2 is running at:
[I 2021-08-13 09:55:44.250 ServerApp] http://at139:8888/lab
[I 2021-08-13 09:55:44.250 ServerApp] or http://127.0.0.1:8888/lab
[I 2021-08-13 09:55:44.250 ServerApp] Use Control-C to stop this server and shut down all kernels (twice to skip confirmation).
ここでインタラクティブノード上のJupyter Labのポート番号（この例の場合8888）を覚えておきます。
SSHポートフォワード
ユーザーのクライアントマシンで新しい端末を起動し、以下のコマンドを実行します。（プロンプトは返ってきません。何もせずこのままつないでおきます。Ctrl-Cで終了します。)
$ ssh -N gw.ddbj.nig.ac.jp -L 3001:172.19.7.186:8888
Enter passphrase for key '/home/youraccount/.ssh/id_rsa':
ここで-Lオプションの意味は以下の通りです。
-L <(1)アクセス時のポート番号>:<(2)インタラクティブノードのIPアドレス>:<(3)Jupyter Labのポート番号>
(1)については適当に決めて良いです。
(2)は上記の「インタラクティブノードのローカルIPアドレス」です。
(3)は上記の「インタラクティブノード上のJupyter Labのポート番号」です。
Webブラウザからのアクセス
ユーザーのクライアントマシンのWebブラウザを用いて以下のURLにアクセスします。
http://localhost:3001
ポート番号は、上記(1)アクセス時のポート番号とします。
アクセスするとパスワードを聞かれるので、上記で設定したパスワードを入力します。
これでJupyter LabのWeb画面が表示されます。
