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新着のお知らせ
国立遺伝学研究所 スーパーコンピュータシステム(NIG SuperComputer)とは
大学共同利用機関法人 情報システム研究機構 国立遺伝学研究所は、2012年3月にスーパーコンピュータシステムを更新しました。新しいスーパーコンピュータシステムはゲノム解析を主な目的とした大規模計算機利用拠点として 最新鋭の大規模クラスタ型計算機、大規模メモリ共有型型計算機、および大容量高速ディスク装置で構成されたスーパーコンピューティングシステムサービスを提供しています。
本サイトは国立遺伝学研究所スーパーコンピュータシステムが提供する計算機リソース、各種アプリケーション、それらの利用方法についての各種情報を提供します。DDBJセンターとして提供する各種サービスについてはDDBJセンターのホームページからご参照ください。
ディスク利用状況
UGEキュー利用状況概要
現在のUGEキューの利用状況概要です。データは10分置きに更新されます。
下記表は、各計算ノードのスロット、メモリの使用率を表します。
ジョブ投入にあたり、混在状況の参考にして下さい。
利用状況により、新規ジョブは、待ち合わせ時間が発生する可能性があります。
研究用fat/medium計算ノード
| qname | host |
slot (スロット数) |
memory (GB) |
| use / all prcent | disabled |
in use | req / all percent |
研究用thin計算ノード
| qname | host |
slot (スロット数) |
memory (GB) |
| use / all percent | disabled |
in use | req / all percent |
業務用thin計算ノード
| qname | host |
slot (スロット数) |
memory (GB) |
| use / all percent | disabled |
in use | req / all percent |
slot
(単位：スロット数) |
use |
使用中のジョブスロット数です |
| all |
キューが保有する全ジョブスロット数です |
| percent |
使用中ジョブのスロット使用率です |
| disabled |
メンテナンス等の理由で無効化されている、または高負荷等の理由で使用できないジョブスロットの数です |
memory
(単位：GB) |
in use |
現在使用中のメモリ量の合計です |
| req |
現在動作中のジョブによって確保されているメモリ量の合計です |
| all |
ホストが保有するメモリ量の合計です |
| percent |
現在動作中ジョブのメモリ確保率です |
percent
(スロット使用率
メモリ確保率) |
0%～50% |
 |
| 51%～79% |
 |
| 80%～100% |
 |
システムからのお知らせ
引用文献
Nucleic Acids Res. 2013 Jan;41(Database issue):D25-9. doi: 10.1093/nar/gks1152. Epub 2012 Nov 24.
DDBJ new system and service refactoring.
Ogasawara O, Mashima J, Kodama Y, Kaminuma E, Nakamura Y, Okubo K, Takagi T.
