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Slurmパーティションの構成

個人ゲノム解析区画では、申請時の計算ノード構成に対してSlurmのパーティションはParabricksパーティション1つが利用申請された計算ノードを全て含んだ デフォルトパーティションとして設定されます。

パーティション設定の概要(特に個別指定がない場合の設定)

パーティション名所属ノードジョブの最大実行時間最大利用可能CPU最大利用可能メモリ最大利用可能GPU
parabricks申請された計算ノード全て無制限ノードが保持するCPUコア数の合算計算ノードが保持する搭載メモリ量の合算ノードが搭載するGPU数の合算
  • ユーザ毎の個別制限、権限付与はかけていません。
  • squeueコマンドでパーティションに投入された全ユーザジョブがリストに表示される設定になっています。(変更は可能)

詳細設定内容については、申請窓口からの提供情報を申請完了時にご確認ください。 デフォルト構成ではなく、カスタマイズした構成がご要望の場合

  • インタラクティブ(ログイン)ジョブ用ノードの要否。それに伴うSlurmのインタラクティブパーティションの設定について
  • Parabricksパーティション(デフォルト)以外に追加するパーティション設定要望
  • 各パーティションにかける追加の制限設定要望
  • 特定ユーザにかける個別の制限、または権限設定など(必要であれば)

について、新規申請時にご指定、ご相談ください。詳細設定情報については申請完了後にお知らせします。個別設定をご依頼いただいた場合、設定の複雑さによって申請完了までにお時間をいただく場合があります。

完了時の提供情報と併せてその他のコマンドでパーティション構成を確認するコマンド群の使用方法をご参照頂き、 ログイン後にパーティションの実際の設定状況をご確認ください。