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Parabricks の無料化などに伴い GPU ノードの利用者が増加していることから、より多くの研究者の方に GPU ノードを利用していただけるよう、個人ゲノム解析区画 GPU ノード専用の Slurm パーティションを作成しました。

この新しい Slurm パーティションでは、実際に計算が実行されている時間だけが課金対象となります。

これにより GPU ノードの占有時間が減り、より多くの人に GPU を利用していただけるようになります。

これに伴い、GPU ノードの料金体系を第２期から変更いたします。

利用計画表と料金表の詳細については、以下のリンクをご参照ください。

• 利用計画表

• 料金表

利用方法は以下のリンクをご参照ください。

• 個人ゲノム解析区画 Slurm GPU キューの利用方法

国立国際医療研究センター　河合洋介先生により、ヒト全ゲノム解析の公共データの再解析データセットが公開されました。

「公的データベースにオープンアクセスで公開されているヒトの全ゲノム解析データを再解析したデータを遺伝研スパコン上で共有します。」（「活用方法」>「2023年のトピック」ヒト全ゲノム解析の公共データの再解析データセット より）

2022年7月に申請システムの刷新を行ったため、今年度(2022年度) 年度末アカウント継続申請にあたって、システムの不具合が生じる事案が発生しております。対処方法につきましてはFAQにまとめましたので、そちらをご覧ください。

ご不便をおかけし申し訳ありませんが、年度末更新のシステム不具合に伴う混乱を避けるために年度末更新の期日を以下のように延長します。

申請受付期間​

2023年1月1日 - 2023年3月31日(金) 2023年5月7日(日)　に延長

申請登録後にご提出いただく誓約書へのサインが、電子サインでできるようになりました。

詳細は、「誓約書に署名する方法」をご参照ください。

遺伝研スパコンへの質問・回答などの議論を行う場としてGithub Discussionsのサイトを開設しました。

🔗https://github.com/nig-sc/nigsc_homepage2/discussions

• 質問・回答を行うにはgithubのアカウントを取得してください。
• スパコンチームに限らず質問に対する解決策をご存じの方は回答を書き込んでいただけますと助かります。
• sc-helpdeskにいただいたご質問についても他のユーザの参考になると考えられる場合はご協力をお願いする場合があります。
• 今後同様の問題に直面したユーザの助けにもなると思いますので、ご協力いただけますと幸いです。

また、スパコンホームページに対するユーザからの記事の追記も募集します。

githubリポジトリに対してプルリクエストをお送りいただければ対応いたします。

🔗https://github.com/nig-sc/nigsc_homepage2

株式会社ゲノムアナリティクスジャパンにより、インピュテーションサーバについて、NBDC-DDBJ インピュテーションサーバのシステムが開発されました。

「日本の研究者が利用しやすい日本版インピュテーションサーバとして、NBDC-DDBJ インピュテーションサーバのシステムを開発しました。現在このシステムは、国立遺伝学研究所スーパーコンピュータシステム の 個人ゲノム解析区画 で利用可能です。」（NBDC-DDBJインピュテーションサーバ (beta)のページより）

• NBDC-DDBJインピュテーションサーバ (beta)の紹介（「活用方法」>「2022年以前のトピック」)

ホームページに遺伝研スパコンの使用電力の状況についてページを追加しました。

• 「遺伝研スパコンの使用電力の状況 」のページ

以下のリンクをクリックすると、最近一週間で遺伝研スパコンに使用した電力に関するグラフがリアルタイムで表示されます。

• 「🔗遺伝研スパコンの使用電力の状況」

混雑対策のために、Lustre8の解析用ストレージを300TB追加しました。

• 利用申請フォームの URL はこちらです。=>利用申請
• 申請についての説明はこちらです。=>利用申請・変更

• 利用申請がより簡単になりました。
• 新規利用申請フォームで、SSH 公開鍵の登録ができるようになりました。
  • これまでの手順では、新規利用申請後、おおよそ 1 週間程度でアカウント登録証を受け取り、ユーザご自身でログインした後に SSH 公開鍵の登録を行う 2 段階方式でした。
  • しかし今後は、新規利用申請フォームの中で SSH 公開鍵の登録も行うことができます。
• 年度末アカウント継続申請が容易になりました。
  • すべての項目を 1 つ 1 つ手入力する必要がなくなり、PubMedID を入力するだけで論文情報が取得・自動入力できるようになります。

注意事項​

• 公開鍵などの設定直後は gw2.ddbj.nig.ac.jp からログインして頂けますようお願いします。
  • 現在、新しい利用申請システムへの移行作業を行っております。そのため、新しいゲートウェイ gw2.ddbj.nig.ac.jp への公開鍵登録については即時設定が反映されますが、古い方のゲートウェイ gw.ddbj.nig.ac.jp へ設定が反映されるまでに１日程度かかります。次回の定期メンテナンス（12 月）の際に、古いゲートウェイにも即時設定が反映されるようシステムを改修する予定です。
• sc2.ddbj.nig.ac.jp サーバは閉鎖しました。

ホームページに ユーザ権限で使えるパッケージマネージャ Guix, spack, nix についてページを追加しました。

以下のパッケージマネージャはユーザ権限だけで利用可能です。開発・解析環境の構築が容易になります。

• Guix (✨5/19 更新)
• spack (✨5/19 更新)
• Environmental Modules (4/13)