NIG Supercomputer

(終了)【定期メンテナンス】11 月 24 日~11 月 30 日 定期メンテナンスのお知らせ

遺伝研の法定停電に合わせて、以下の日時で遺伝研スパコンの定期メンテナンスを予定しています。定期メンテナンス中はスパコンの利用は出来ません。

期間

2023 年 11 月 24 日(金) 17時00分 ~ 11 月 30 日(木) 17時00分 (24h表記)

作業日程

作業内容

定期メンテナンスの作業内容は以下のとおりです。

  1. ソフトウェアバージョンアップ
  2. OS 移行 (CentOS 7.9 から Ubuntu Linux 22.04LTS への移行)
    • OS 移行に伴う FAQ のページを作成しました\🆕/
    • MediumノードとFatノードのハードウェア(HPE ProLiant DL560 Gen10とHPE Superdome Flex)は、Ubuntu Linuxをサポートしていないため、今回の定期メンテナンス時にCent OS 7.9からUbuntu Linux 22.04に移行できず、Cent OS 7.9のままとなっております。
  3. Grid Engine のバージョンアップ
  4. OS 移行しなかった Cent OS に対する yum update
  5. InfininBand, Lustre のファームウェア及びデバイスドライババージョンアップ
  6. LDAP 構成変更
  7. UPS 点検作業

ソフトウェアバージョンアップの内容

表: 開発/解析用ソフトウェアバージョンアップ計画

# ソフトウェア 定期メンテナンス前 定期メンテナンス後
(1) Apptainer 1.1 1.2.2-1
(2) SingularityCE 3.10.2 3.11.4
(3) NVIDIA HPC SDK
(旧 PGI コンパイラ)
22.9 23.7
(4)* NVIDIA CUDA 12.2 12.1
(5) Intel OneAPI 2022.2.0 2023.2.0
(6) Altair Grid Engine 8.6.19/8.6.4 8.8.1

*: CUDA については Ubuntu Linux 22.04LTS GA カーネルの対応バージョンが 12.1 なので、12.1 にダウングレードされます。

OS 移行 (CentOS 7.9 から Ubuntu Linux 22.04LTS への移行)

CentOS 7 が 2024 年 6 月 30 日に End-Of-Life を迎えることを受け、定期メンテナンスで CentOS 7.9 から Ubuntu Linux 22.04LTS への移行を行います。

一般解析区画

個人ゲノム解析区画

留意事項

Last updated: 2023-11-24