掲載日 : 2023 年 10 月 2 日
遺伝研の法定停電に合わせて、以下の日時で遺伝研スパコンの定期メンテナンスを予定しています。定期メンテナンス中はスパコンの利用は出来ません。
期間
2023 年 11 月 24 日(金) 17:00 ～ 11 月 30 日(木) 17:00
作業日程
- 11/24(金) 17:00～ スパコン停止作業
- 11/25(土) 法定停電
- 11/26(日) ～ 29(水) スパコン定期メンテナンス作業(UPS 保守点検、Lustre 保守点検、ソフトウェアアップデート、その他)
- 11/30(木)は予備日です。
作業内容
定期メンテナンスの作業内容は以下のとおりです。
- ソフトウェアバージョンアップ
- OS 移行 (CentOS 7.9 から Ubuntu Linux 22.04LTS への移行)
- OS 移行に伴う FAQ のページを作成しました＼🆕／
- MediumノードとFatノードのハードウェア（HPE ProLiant DL560 Gen10とHPE Superdome Flex）は、Ubuntu Linuxをサポートしていないため、今回の定期メンテナンス時にCent OS 7.9からUbuntu Linux 22.04に移行できず、Cent OS 7.9のままとなっております。
- Grid Engine のバージョンアップ
- OS 移行しなかった Cent OS に対する yum update
- InfininBand, Lustre のファームウェア及びデバイスドライババージョンアップ
- LDAP 構成変更
- UPS 点検作業
ソフトウェアバージョンアップの内容
表: 開発/解析用ソフトウェアバージョンアップ計画
| # | ソフトウェア | 定期メンテナンス前 | 定期メンテナンス後 |
| (1) | Apptainer | 1.1 | 1.2.2-1 |
| (2) | SingularityCE | 3.10.2 | 3.11.4 |
| (3) | NVIDIA HPC SDK (旧 PGI コンパイラ) | 22.9 | 23.7 |
| (4)* | NVIDIA CUDA | 12.2 | 12.1 |
| (5) | Intel OneAPI | 2022.2.0 | 2023.2.0 |
| (6) | Altair Grid Engine | 8.6.19/8.6.4 | 8.8.1 |
*: CUDA については Ubuntu Linux 22.04LTS GA カーネルの対応バージョンが 12.1 なので、12.1 にダウングレードされます。
OS 移行 (CentOS 7.9 から Ubuntu Linux 22.04LTS への移行)
CentOS 7 が 2024 年 6 月 30 日に End-Of-Life を迎えることを受け、定期メンテナンスで CentOS 7.9 から Ubuntu Linux 22.04LTS への移行を行います。
一般解析区画
- 一般解析区画のすべての計算ノードに関して CentOS 7.9 から Ubuntu Linux 22.04LTS への移行を行います。これに伴い、解析環境の再インストールが必要になる場合があります。各自で必ず開発環境を確認し、解析環境の再インストールをお願いいたしま す。
- 計算ノードの占有利用を行っているユーザに対しては、定期メンテナンス時の OS 移行を希望するかどうかメールで問い合わせを行います。ご都合の良い OS 移行の時期をお知らせください。
個人ゲノム解析区画
- Slurm 配下の GPU 計算ノードについては、CentOS 7.9 から Ubuntu Linux 22.04LTS への移行を行います。これに伴い、解析環境の再インストールが必要になる場合があります。各自で必ず開発環境を確認し、解析環境の再インストールをお願いいたします。
- 計算ノードの占有利用を行っているユーザに対しては、定期メンテナンス時の OS 移行を希望するかどうかメールでの問い合わせを行います。ご都合の良い OS 移行の時期をお知らせください。
留意事項
- 稼働中のジョブは削除されますので、定期メンテナンス終了後ジョブを再投入してください。