概要(一般解析区画)
一般解析区画のシステム構成
遺伝研スパコン一の般解析区画は多数の計算機(これらをノードと呼びます)を束ねたクラスタ構成となっています。
ユーザーからの計算要求に対してクラスタ計算機システム上の適切な計算機を割り当てる仕事をするのがジョブスケジューラと呼ばれるプログラムです。 遺伝研スパコンでは、バイオインフォマティックス系で広く用いられて きたSun Grid Engineの後継であるGrid Engineをジョブスケジューラとして使っています。
Grid Engineで管理された全てのノードは大容量高速ストレージシステム (Lustre FS)をマウントしており、ユーザーのホームディレクトリは全てのノードから同じようにアクセスできます。