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ログイン方法(一般解析区画)

概要​

遺伝研スパコンの一般解析区画へのログインには ssh 接続を用います。

ゲートウェイノードは ２つあります​

遺伝研スパコンの一般解析区画のゲートウェイノードは、以下の 2 つがあります。

  • gw.ddbj.nig.ac.jp
  • gw2.ddbj.nig.ac.jp

ログインの手順​

1, ターミナルエミュレータを開き、ssh アカウント名@ゲートウェイノード名 を入力し、enter を押下します。 （Windows PowerShell の SSH クライアントの場合も同じです。）

$ ssh youraccount@gw.ddbj.nig.ac.jp

または

$ ssh youraccount@gw2.ddbj.nig.ac.jp

秘密鍵の格納場所が~/.ssh/id_rsa以外の場合は以下のように秘密鍵のパスを指定します。

ssh -i ~/yourpath/id_rsa youraccount@gw.ddbj.nig.ac.jp

2, "Enter passphrase for key ..."のプロンプトに対し、SSH 鍵ペアのパスフレーズを入力し、enter を押下します。

※ 鍵のパスフレーズ入力後に以下のメッセージが出力された場合は、yes を入力してください。

Are you sure you want to continue connecting (yes/no)?

3, qlogin コマンドを実行し、ログインノードにログインします。

$ qlogin

パスワード入力後に以下のメッセージが出力された場合は、yes を入力してください。

Are you sure you want to continue connecting (yes/no)?

実行例​

以下のように表示されれば成功です。

$ ssh youraccount@gw.ddbj.nig.ac.jp
Enter passphrase for key '/home/youraccount/.ssh/id_rsa': 
Last login: Sun Sep 26 15:03:33 2021 from XXX.XXX.XXX.XXX
---------------------------------------------------------------------
Thank you for using NIG supercomputer system.
This is the gateway node, do not run program here.
Please use 'qlogin' to login to a login node.
---------------------------------------------------------------------
$ qlogin
Your job 13867668 ("QLOGIN") has been submitted
waiting for interactive job to be scheduled ...
Your interactive job 13867668 has been successfully scheduled.
Establishing /home/geadmin/UGER/utilbin/lx-amd64/qlogin_wrapper session to host at138 ...
Last login: Sun Sep 26 15:29:09 2021 from gw1
$

うまく行かない場合は、よくある質問(FAQ)を参照してください。

利用可能メモリに関する注意​

ログインノードで利用可能なメモリはデフォルトでは 4GB です。 これを増やすには以下のようにqlogin時にメモリ量を指定してください。

qlogin -l s_vmem=10G -l mem_req=10G

参考​

GPU ノードの利用方法​

GPU を用いたプログラムの開発や動作テストの目的で、GPU を搭載したログインノードを１台用意しています。 このログインノードを使うには、-l gpuオプションを付けてqloginしてください。

qlogin -l gpu
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