2014年7月18日 ソフトウェアインストールのお知らせ
国立遺伝学研究所スーパーコンピュータシステム利用者各位
2014年7月18日
国立遺伝学研究所 DDBJセンター スーパーコンピュータシステム管理チーム
平素より、国立遺伝学研究所(以下 遺伝研) スーパーコンピュータシステム(以下 スパコン)を ご利用いただき誠に有難うございます。
7月18日に以下、ソフトウェアのインストールを行いました。
なお、各ソフトウェアのcurrentへのリンクは変更ありません。詳細はこちらを参照下さい。
1.詳細
- ソフト名称:ALLPATHS-LG
version:50095
インストール先 /usr/local/pkg/ALLPATHS-LG/50095/
- ソフト名称:BEDTools
version:2.17.0
インストール先 /usr/local/pkg/BEDTools/2.17.0/
- ソフト名称:BLAT
version:35
インストール先 /usr/local/pkg/BLAT/35/
- ソフト名称:GATK
version:1.6-9-g47df7bb
インストール先 /usr/local/pkg/GATK/1.6-9-g47df7bb/
- ソフト名称:SOAPdenovo
version:2.04-r240
インストール先 /usr/local/pkg/SOAPdenovo/2.04-r240/
- ソフト名称:Trinity
version:r20140413p1
インストール先 /usr/local/pkg/Trinity/r20140413p1/
- ソフト名称:bowtie
version:1.0.1
インストール先 /usr/local/pkg/bowtie/bowtie-1.0.1/
- ソフト名称:bowtie2
version:2.2.3
インストール先 /usr/local/pkg/bowtie2/2.2.3/
- ソフト名称:bwa
version:0.7.9a
インストール先 /usr/local/pkg/bwa/0.7.9a/
- ソフト名称:mafft
version:7.158
インストール先 /usr/local/pkg/mafft/7.158/
- ソフト名称:ncbi_cxx_toolkit
version:12.0.0
インストール先 /usr/local/pkg/ncbi_cxx_toolkit/12.0.0/
- ソフト名称:samtools
version:0.1.19
インストール先 /usr/local/pkg/samtools/0.1.19/
- ソフト名称:velvet
version:1.2.10
インストール先 /usr/local/pkg/velvet/velvet_1.2.10/
以上、宜しくお願いします。