2014年7月18日 ソフトウェアインストールのお知らせ

国立遺伝学研究所スーパーコンピュータシステム利用者各位

2014年7月18日
国立遺伝学研究所 DDBJセンター スーパーコンピュータシステム管理チーム

平素より、国立遺伝学研究所(以下 遺伝研) スーパーコンピュータシステム（以下 スパコン）を ご利用いただき誠に有難うございます。

7月18日に以下、ソフトウェアのインストールを行いました。

なお、各ソフトウェアのcurrentへのリンクは変更ありません。詳細はこちらを参照下さい。

１．詳細

• ソフト名称：ALLPATHS-LG

　　　version：50095

　　　インストール先 /usr/local/pkg/ALLPATHS-LG/50095/

• ソフト名称：BEDTools

　　　version：2.17.0

　　　インストール先 /usr/local/pkg/BEDTools/2.17.0/

• ソフト名称：BLAT

　　　version：35

　　　インストール先 /usr/local/pkg/BLAT/35/

• ソフト名称：GATK

　　　version：1.6-9-g47df7bb

　　　インストール先 /usr/local/pkg/GATK/1.6-9-g47df7bb/

• ソフト名称：SOAPdenovo

　　　version：2.04-r240

　　　インストール先 /usr/local/pkg/SOAPdenovo/2.04-r240/

• ソフト名称：Trinity

　　　version：r20140413p1

　　　インストール先 /usr/local/pkg/Trinity/r20140413p1/

• ソフト名称：bowtie

　　　version：1.0.1

　　　インストール先 /usr/local/pkg/bowtie/bowtie-1.0.1/

• ソフト名称：bowtie2

　　　version：2.2.3

　　　インストール先 /usr/local/pkg/bowtie2/2.2.3/

• ソフト名称：bwa

　　　version：0.7.9a

　　　インストール先 /usr/local/pkg/bwa/0.7.9a/

• ソフト名称：mafft

　　　version：7.158

　　　インストール先 /usr/local/pkg/mafft/7.158/

• ソフト名称：ncbi_cxx_toolkit

　　　version：12.0.0

　　　インストール先 /usr/local/pkg/ncbi_cxx_toolkit/12.0.0/

• ソフト名称：samtools

　　　version：0.1.19

　　　インストール先 /usr/local/pkg/samtools/0.1.19/

• ソフト名称：velvet

　　　version：1.2.10

　　　インストール先 /usr/local/pkg/velvet/velvet_1.2.10/

以上、宜しくお願いします。