Archaea tools(旧 HCPtools) の使い方
遺伝研スパコンに対してファイルのアップロード、ダウンロードを行うには、一般的に広く用いられているファイル転送ソフトウェアであるscp
やsftp
をつかうことができますが、scp
などでは遠距離間で大量のファイルを転送する際に転送速度が遅くなる性質があります。
遠距離の高速通信のために、遺伝研スパコンでは、一般解析区画では Aspera、個人ゲノム解析区画では Archaea tools(旧 HCPtools)というファイル転送ソフトウェアが利用可能となっています。
参考資料
- 各製品ごとの公式マニュアルは、🔗Bytix 公式ページ「ドキュメント」のページをご参照ください。
- 最新バージョンは、🔗Bytix 公式ページ「ダウンロード【最新版】」のページをご参照ください。
- FAQ(よくある質問): HCP tools
ソフトウェアの改称について
2022 年 10 月、HCPtools ソフトウェア提供元が、データ転送系のブランド名称として、「Bytix(バイティックス)」というブランド名を立ち上げ、製品名称が「HCPtools」から「Archaea tools」へ変更になりました。
製品名称変更後も、これまで通り HCPtools で使用していたコマンドと同じコマンドをそのままお使 いいただけます。
変更についての詳細は、🔗Bytix 公式ページ「製品名称変更等について」のページをご参照ください。
クライアントソフトウェアのインストール
Archaea tools(旧 HCPtools)を利用するためにはクライアントソフトウェアをユーザのクライアント計算機にインストールする必要があります。 お使いのクライアント計算機の環境に応じて以下の文書をご参照ください。
- Linux の場合 (Windows の WSL2 環境の場合も含む)
- 🔗Mac OS の場合
- 🔗Windows の場合
設定ファイルの設置方法
遺伝研スパコンとのデータの受送信を行うためにはホームデ ィレクトリに Archaea tools(旧 HCPtools)の設定ファイルを設置する必要があります。遺伝研スパコン用の設定ファイルは github からクローンして取得してください。
Linux (Windows の WSL2 環境の場合も含む)
cd $HOME
git clone https://github.com/nig-sc/Bytix_Archaea/ .hcp
Mac OS の場合
cd $HOME
git clone https://github.com/nig-sc/Bytix_Archaea/ .hcp
Windows (PowerShell)の場合
cd $HOME
git clone https://github.com/nig-sc/Bytix_Archaea/ _hcp
git clone すると以下のファイルが作られます。
$ tree .hcp
.hcp
├── README.md
├── hchmod.conf
├── hchown.conf
├── hcp-common.conf
├── hcp-ls.conf
├── hcp.conf
├── hln.conf
├── hmkdir.conf
├── hmv.conf
├── hpwd.conf
├── hrm.conf
└── hsync.conf
1 directory, 12 files